痛风结石好发于肾脏主要有两方面的原因：

（1）血中尿酸的排泄主要通过肾脏，大约75%-80%的尿酸由肾脏排出，20%左右的尿酸经由胆道进入肠道，随粪便排出。其它器官如肺、胰等几乎不排泌尿酸，所以尿酸易在肾脏内沉积形成肾结石。尤其是血中尿酸浓度过高超过肾脏的排泄能力时，肾脏痛风结石更容易发生。

（2）尿酸沉积与局部组织环境的酸碱度有关（即PH值）。当局部偏酸时，即HP值偏低时尿酸容易沉积形成结石；当局部偏碱时，即PH值偏高时，尿酸不易在局部沉积。正常人血液PH值为7.35~7.45（中性）。肝、肺、心、脑等组织的PH值与血液相近，而且又不是尿酸分泌的场所，所以尿酸不易沉积形成结石。而肾脏是尿液形成的场所，尿液的PH值一般在5.5~6 左右，呈酸性，加上尿酸主要由尿中排出，所以易在肾脏内沉积而形成结石。有时则在输尿管及膀胱内沉积形成结石。在少数情况下，痛风石也可在大血管壁、心内膜及胆道内形成，但这种病例是极少见的。